Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BckdkO55028 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms