Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms