Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms