Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4aF8VPX6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms