Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
6030445D17RikE9Q8F9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
6030445D17RikE9Q8F9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms