Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms