Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd4A2AKM2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms