Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc1bQ9WV32 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc1bQ9WV32 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms