Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms