Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Col5a3Q9JLI2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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Col5a3Q9JLI2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 408.8 ms