Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.3 ms