Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms