Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D3J9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D3J9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D3J9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms