Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lactb2Q99KR3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms