Protein–RNA interactions for Protein: Q921Y2

Imp3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Imp3Q921Y2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Imp3Q921Y2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Imp3Q921Y2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Imp3Q921Y2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Imp3Q921Y2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Imp3Q921Y2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Imp3Q921Y2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Imp3Q921Y2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Imp3Q921Y2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Imp3Q921Y2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Imp3Q921Y2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Imp3Q921Y2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Imp3Q921Y2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Imp3Q921Y2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms