Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Smg8Q8VE18 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Smg8Q8VE18 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Smg8Q8VE18 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Smg8Q8VE18 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Smg8Q8VE18 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Smg8Q8VE18 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Smg8Q8VE18 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Smg8Q8VE18 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smg8Q8VE18 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms