Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Card11Q8CIS0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Card11Q8CIS0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Card11Q8CIS0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Card11Q8CIS0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Card11Q8CIS0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Card11Q8CIS0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Card11Q8CIS0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Card11Q8CIS0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Card11Q8CIS0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Card11Q8CIS0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Card11Q8CIS0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms