Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1409.8 ms