Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot1Q6ZQ08 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms