Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NipblQ6KCD5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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