Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms