Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228bQ497Q6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam228bQ497Q6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms