Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc9a2Q3ZAS0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc9a2Q3ZAS0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc9a2Q3ZAS0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc9a2Q3ZAS0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc9a2Q3ZAS0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc9a2Q3ZAS0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc9a2Q3ZAS0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc9a2Q3ZAS0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms