Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brf2Q3UAW9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms