Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
rp9P97762 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
rp9P97762 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
rp9P97762 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
rp9P97762 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
rp9P97762 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
rp9P97762 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
rp9P97762 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
rp9P97762 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
rp9P97762 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
rp9P97762 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
rp9P97762 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
rp9P97762 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
rp9P97762 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
rp9P97762 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
rp9P97762 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
rp9P97762 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
rp9P97762 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
rp9P97762 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
rp9P97762 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
rp9P97762 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
rp9P97762 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
rp9P97762 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
rp9P97762 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
rp9P97762 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
rp9P97762 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
rp9P97762 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
rp9P97762 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
rp9P97762 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
rp9P97762 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
rp9P97762 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
rp9P97762 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
rp9P97762 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
rp9P97762 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
rp9P97762 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
rp9P97762 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
rp9P97762 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
rp9P97762 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
rp9P97762 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
rp9P97762 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
rp9P97762 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
rp9P97762 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
rp9P97762 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
rp9P97762 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
rp9P97762 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
rp9P97762 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
rp9P97762 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
rp9P97762 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
rp9P97762 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
rp9P97762 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
rp9P97762 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
rp9P97762 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
rp9P97762 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
rp9P97762 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
rp9P97762 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
rp9P97762 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
rp9P97762 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
rp9P97762 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
rp9P97762 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
rp9P97762 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
rp9P97762 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
rp9P97762 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
rp9P97762 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
rp9P97762 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
rp9P97762 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
rp9P97762 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
rp9P97762 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
rp9P97762 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
rp9P97762 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
rp9P97762 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms