Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psme1P97371 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme1P97371 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme1P97371 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme1P97371 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Psme1P97371 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psme1P97371 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Psme1P97371 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme1P97371 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms