Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Tmod1P49813 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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