Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rom1P32958 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rom1P32958 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rom1P32958 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rom1P32958 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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