Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp1P29452 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp1P29452 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp1P29452 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp1P29452 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp1P29452 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp1P29452 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp1P29452 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.2 ms