Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhoP15409 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhoP15409 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhoP15409 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhoP15409 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhoP15409 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhoP15409 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhoP15409 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RhoP15409 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhoP15409 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhoP15409 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhoP15409 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhoP15409 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhoP15409 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhoP15409 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhoP15409 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhoP15409 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhoP15409 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhoP15409 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhoP15409 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhoP15409 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhoP15409 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RhoP15409 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RhoP15409 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RhoP15409 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RhoP15409 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RhoP15409 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RhoP15409 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RhoP15409 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RhoP15409 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RhoP15409 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhoP15409 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RhoP15409 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RhoP15409 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RhoP15409 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RhoP15409 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhoP15409 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhoP15409 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhoP15409 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms