Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NclP09405 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NclP09405 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NclP09405 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NclP09405 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NclP09405 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NclP09405 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NclP09405 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NclP09405 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NclP09405 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NclP09405 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NclP09405 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NclP09405 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NclP09405 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NclP09405 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NclP09405 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NclP09405 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NclP09405 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NclP09405 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NclP09405 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NclP09405 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NclP09405 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NclP09405 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NclP09405 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NclP09405 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NclP09405 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NclP09405 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NclP09405 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NclP09405 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NclP09405 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NclP09405 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NclP09405 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NclP09405 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NclP09405 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NclP09405 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NclP09405 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NclP09405 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NclP09405 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NclP09405 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NclP09405 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NclP09405 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NclP09405 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NclP09405 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NclP09405 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NclP09405 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NclP09405 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NclP09405 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NclP09405 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NclP09405 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NclP09405 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NclP09405 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NclP09405 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NclP09405 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NclP09405 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NclP09405 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NclP09405 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NclP09405 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NclP09405 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NclP09405 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NclP09405 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NclP09405 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NclP09405 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NclP09405 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NclP09405 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NclP09405 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NclP09405 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NclP09405 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NclP09405 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NclP09405 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NclP09405 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NclP09405 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NclP09405 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NclP09405 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NclP09405 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NclP09405 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NclP09405 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NclP09405 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NclP09405 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NclP09405 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NclP09405 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NclP09405 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NclP09405 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NclP09405 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NclP09405 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NclP09405 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NclP09405 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NclP09405 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms