Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk1O54908 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms