Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabep1O35551 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms