Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rnf5O35445 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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