Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf5O35326 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms