Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rfx7F8VPJ6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfx7F8VPJ6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms