Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
2610001J05RikF2Z3Y9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms