Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Svep1A2AVA0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Svep1A2AVA0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Svep1A2AVA0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Svep1A2AVA0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Svep1A2AVA0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms