Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd4A2AKM2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms