Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms