Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PnckQ9QYK9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnckQ9QYK9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnckQ9QYK9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnckQ9QYK9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnckQ9QYK9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnckQ9QYK9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnckQ9QYK9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PnckQ9QYK9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnckQ9QYK9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnckQ9QYK9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnckQ9QYK9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms