Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col5a3Q9JLI2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Col5a3Q9JLI2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms