Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3glb1Q9JK48 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3glb1Q9JK48 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3glb1Q9JK48 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3glb1Q9JK48 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3glb1Q9JK48 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3glb1Q9JK48 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms