Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms