Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph3bQ9DA80 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph3bQ9DA80 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph3bQ9DA80 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph3bQ9DA80 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph3bQ9DA80 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph3bQ9DA80 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph3bQ9DA80 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph3bQ9DA80 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rsph3bQ9DA80 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph3bQ9DA80 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms