Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Vstm5Q9D806 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Vstm5Q9D806 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm5Q9D806 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Vstm5Q9D806 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vstm5Q9D806 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vstm5Q9D806 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm5Q9D806 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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