Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkrip1Q9CWV6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkrip1Q9CWV6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms