Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc96Q9CR92 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc96Q9CR92 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms