Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB7

Rnf141, RING finger protein 141, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf141Q99MB7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf141Q99MB7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf141Q99MB7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 255.2 ms