Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem260Q8BMD6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem260Q8BMD6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem260Q8BMD6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem260Q8BMD6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms